PMA.core 3.0.1

This page is read only. You can view the source, but not change it. Ask your administrator if you think this is wrong.
===== อินเตอร์เฟซ ANNotation ของ Pathomation =====

PMANN เป็นส่วนหนึ่งของ [[th:interfacing_the_server_from_3rd_party_software|Pathomation back-end API]] การจัดการ [[th:working_with_annotations|คำอธิบายประกอบ]] (ภายนอก) ที่แตกต่างกันทำได้ง่ายขึ้น 

PMA.core สามารถใช้ประโยชน์จากการใช้ PMANN ผ่านอินเทอร์เฟซของไฟล์ภายนอกและคำสั่ง API ที่เกี่ยวข้อง
คำสั่ง API เหล่านี้เกี่ยวข้องกับไฟล์จำนวนหนึ่ง ที่มีคำอธิบายประกอบจากภายนอกบนสไลด์
PMA.core รองรับคำอธิบายประกอบจากภายนอกผ่านผู้จำหน่าย Visioharm, Indica Labs และ Aperio โดยไฟล์แต่ละรูปแบบต่อไปนี้จะได้ถูกรองรับผ่านการแยกวิเคราะห์ไฟล์เฉพาะตามผู้จำหน่ายที่เกี่ยวข้อง:
  * Visiopharm .mld
  * Indica Labs .annotations
  * Aperio .xml

ในการเชื่อมโยงไฟล์ภายนอกกับสไลด์ คุณต้องใช้คำสั่ง API [[https://docs.pathomation.com/pma.core.api/#/Api/Slide_SetExternalAnnotationFiles|SetExternalAnnotationFiles]] โดยการดำเนินการนี้จะใช้ กลุ่มของชุดข้อมูลที่คงที่ (Array of tuples) ที่มี ชื่อ และ เส้นทาง สำหรับไฟล์คำอธิบายประกอบภายนอกที่เกี่ยวข้องในแต่ละไฟล์
สำหรับ ชื่อ คุณสามารถใช้ข้อความใดก็ได้เพื่อแยกความแตกต่างจากคำอธิบายประกอบอื่นๆ และ เส้นทาง จะต้องเป็นพาธเสมือน ไปยังไฟล์ที่มีคำอธิบายประกอบ คุณสามารถรับไฟล์คำอธิบายประกอบภายนอกที่ตั้งค่าไว้ก่อนหน้านี้สำหรับสไลด์ผ่านคำสั่ง API [[https://docs.pathomation.com/pma.core.api/#/Api/Slide_GetExternalAnnotationFiles|GetExternalAnnotationFiles]] ซึ่งจะส่งคืนชุดข้อมูลของ ชื่อ/เส้นทาง สำหรับแต่ละไฟล์ที่เกี่ยวข้องกับสไลด์

===== ตัวอย่าง =====

สมมติว่าเรามีสไลด์ชื่อ Slide.mrxs ซึ่งต้องการแนบไฟล์คำอธิบายประกอบจำนวน 2 ไฟล์จากแหล่งที่มาภายนอก และทั้งสองไฟล์อยู่ในไดเรกทอรีเสมือนชื่อว่า Slides
  * Slide1.mld
  * Slide1.xml
ไฟล์แรกมีข้อมูลการนับเซลล์บางส่วนและไฟล์ที่สองมีข้อมูลบางประการที่น่าสนใจ เราจึงมีการตั้งชื่อเพื่อให้สามารถแยกแยะได้ง่ายขึ้น โปรดทราบว่าชื่อไฟล์ภายนอกจะแสดงต่อผู้ใช้ในโปรแกรมทั้งหมดของแพลตฟอร์ม Pathomation ดังนั้นเราจึงใช้คำสั่ง API [[https://docs.pathomation.com/pma.core.api/#/Api/Slide_SetExternalAnnotationFiles|SetExternalAnnotationFiles]] ด้วยสตริงพารามิเตอร์สำหรับสืบค้น

    ?pathOrUid=Slides/Slide1.mrxs&sessionId={sessionId}
และด้วยข้อมูล json ต่อไปนี้
    [
      {
        "Name": "Cell counting",
        "Path": "Slides/Slide1.mld"
      },
      {
        "Name": "Regions of interest",
        "Path": "Slides/Slide1.xmls"
      }
    ]

เพื่อทดสอบว่าคำสั่งทำงานได้ เราสามารถใช้คำสั่ง [[https://docs.pathomation.com/pma.core.api/#/Api/Slide_GetExternalAnnotationFiles|GetExternalAnnotationFiles]] ที่ควรคืนค่า json เดิมเป็นผลลัพธ์

ตอนนี้เราสามารถเห็นคำอธิบายประกอบภายนอกโดยใช้โปรแกรมสำหรับเรียกดูสไลด์ของแพลตฟอร์ม Pathomation เช่น PMA.studio นอกจากนี้เรายังสามารถปรับการมองเห็นและความทึบสำหรับแต่ละเลเยอร์ได้อย่างอิสระ

{{ ::pma.core_externaljpg.jpg?600 |}}
PMA.core 3.0.1

User Tools

Site Tools

Page Tools
